2016年12月15日 星期四

是誰給了科學家們和醫療人員滿滿的「大平台」!?——Recombinase Polymerase Amplification 之應用與限制


圖片來源:WIKIPEDIA,CC licensed

整理・撰文:王如初、郭芷麟
 繼上一篇了解了 Recombinase Polymerase Amplification (RPA) (全文請點閱此) 的基本原理後,接下來就來跟大家說說這樣的技術,目前有怎樣的應用~

2016年12月2日 星期五

你用過嗎?PCR 界的革命新技術!——Recombinase Polymerase Amplification


圖片來源 / climber via pixabay, CC licensed

整理・撰文:郭芷麟
想一下,是不是每次實驗要做 PCR,我們幾乎都會再安排其他實驗?或是在接近中午的時間點上機,吃飽飯之後再來收 sample

會有這樣預期心理的產生,就是因為我們知道上機之後,大約需要花費 1.5~2 個小時左右的時間等熱循環儀  thermal cycler 來完成反應。雖然 PCR 的發明已經促使我們的研究得以更有效且方便的完成,然而科學家的追求創新的決心,是不可容小看的!

2016年11月2日 星期三

唯有不斷尋求,才有機會找到答案——探索未知的 RNA 區段-RACE


圖片來源 / climber via pixabay, CC licensed
整理・撰文:李俊廷
在顯赫的山壁、巖然的未踏之地上,攀岩者抱持著敬畏的心,以看似樸實卻不失細膩的動作將一個個勾環釘入岩壁。這種逐步探尋未知地帶的模式,在分子生物技術中也見得到。

今天要來跟各位介紹的技術是快速擴增 cDNA 末端 (Rapid Amplification of cDNA Ends, RACE)。如果說在字面上RT-PCR vs. Real-time PCR 還在傻傻分不清楚的話,那 RT-PCR RACE 就是在用途上,容易讓人混淆吧!


雖然 RACE RT-PCR 的變奏版,在原理跟步驟上和 RT-PCR 有很多相似,但 RACE 卻能解決很多特別的問題。例如,分析兩端序列未知的 RNA、界定啟動子 (promoter) 下游、調查部分胺基酸序列已知的基因等

2016年10月27日 星期四

只有堅持到最後,你才會知道你的目標是什麼——諾貝爾生醫獎

soruce: pixabay_science
整理・撰文:郭芷麟、梁博任
走在這條生技道路的你,有想過自己要變成怎樣的科學家嗎?或許你天生資質聰穎,也非常會做實驗,所以理所當然會成為一位傑出的科學家。但,如果是資質平庸的我們,難道遇到一點挫折或是壓力,就果斷放棄自己想要追尋的目標嗎?

其實,很多傑出的科學家,都跟你我一樣,不是什麼天才。他們都是付出比別人更多的努力,以及對於研究的熱忱及堅持,才能得到這樣的殊榮。今天,就來介紹一位傑出的科學家,今年諾貝爾生醫獎得主——大隅良典。

2016年10月17日 星期一

DNA 也會玩大風吹??_Loop-mediated Isothermal Amplification


整理・撰文:王如初


有玩過大風吹嗎?一群小孩子,配上一定少一把的幾張椅子: 「大風吹!」「吹什麼?」「吹有穿/□□的人!」,聽這樣的指令,所有符合條件的小朋友瘋狂的尋找空位,而沒搶到的孩子就只好當下一場遊戲的司令,聚精會神的尋找其他人的共同點。

面對難關,不可或缺的夥伴們——PCR Additives & Enhancers

整理・撰文:梁博任


各位在忙完實驗的閒暇時間,是否會安排休閒活動好好的犒賞一下自己並充充電呢? 小編在這時呢,最愛揪朋友去 KTV 唱歌了。特別是當人手一支麥克風,一同唱出周華健經典的 「朋友」 時,當下真的會覺得平常所遇到的任何難關真的都沒什麼大不了的。其實,不只是我們,在 PCR 的過程中,難免也會遇到一些問題,這時就需要透過一些好朋友的幫助,共同闖蕩這些關卡。那這些好朋友們有誰呢?就讓我們來一同認識一下……

2016年10月11日 星期二

一次快速檢測食品中多種病原菌不是夢!--多重 PCR(Multiplex PCR)




撰文、整理:鄭宇恆



近年來大家對食品安全可說是越來越重視,安全的食品除了需要檢驗有無非法添加劑、重金屬等外,還需要檢測微生物含量是否超標,或是否遭到致病性微生物汙染。所以今天小編就來介紹一種可以應用在食品上的 PCR 技策略--多重 PCRMultiplex PCR)!

2016年10月6日 星期四

DNA 終極解碼器---Inverse PCR


整理撰文:楊孟勳
https://pixabay.com/zh/%E8%AE%BF%E9%97%AE%E6%95%B0%E6%8D%AE-%E5%AF%86%E7%A0%81-%E6%8E%A9%E7%A0%81-%E7%9F%A9%E9%98%B5-%E5%B4%A9%E6%BA%83-%E5%AE%89%E5%85%A8-%E7%AE%A1%E7%90%86%E5%91%98-%E6%94%BB%E5%87%BB-694542/

颱風天剛過,希望大家都平安,不知道大家都在颱風天做什麼呢?聽到外面強烈的風聲及雨聲,小編會戴上耳機將電腦音樂調到最大聲,這樣除了可以使我專心做事之外,也可以掩蓋窗外那令人恐懼的風雨嘶吼聲。
不過說到電腦的音樂檔,不知道你們知不知道,其實電腦的音樂檔也像 DNA 一樣是一串密碼喔!只是他是透過音頻解碼器來組合邏輯電路,將二進制代碼翻譯為特定的對象,藉此發出各種聲音,組合成好聽的音樂。哈!以上太複雜聽不懂沒關係,簡單來說,就是可以透過解碼器來解開一連串複雜的密碼~
那對於 DNA 來說,也有專屬他的解碼器喔~這次小編就來介紹一個屬於 DNA 的終極解碼器-Inverse PCR,就讓我們一起解出 DNA 的交響樂吧!!

2016年9月29日 星期四

RT-PCR vs. Real-time PCR 還在傻傻分不清楚?

整理・撰文:盛威智
(圖為台北市立動物園提供)

動保議題在近幾年是大眾越來越關心的話題,而因棲地減少和破碎化,許多動物都面臨著生存威脅石虎,是除了可能滅絕的雲豹外,台灣僅存的原生貓科動物,若你在野外看到,你有能力去分辨它與家貓的差異之處嗎? 石虎的耳後有白色的斑塊,雙眼內側有兩道白色條紋,而身上則有很多像錢幣大小的黑色斑塊,下次若遇見牠可別再和一般的貓咪搞混了呢!

生活中常有許多事情會搞混,而種類多變的PCR當然也不例外,大家還記得幾個星期以前向你們介紹的Real - time polymerase chain reactionqPCR?,今天小編要介紹的是,就算是科學家有時候也會把它跟Real - time PCR搞混的RT-PCR,全名為逆轉錄聚合酶鏈鎖反應(Reverse transcription polymerase chain reaction)



2016年8月27日 星期六

長的!哎呀!我的 band 出不來啊!—— Long Range PCR


整理・撰文:李俊廷

蓋一棟高樓大廈並不是一件簡單的事,從力學角度來說,高樓大廈的梁柱必須承受比一般房子更大的壓力,同時,樓側需要抗衡強風的受力面積也超過一般的建築。你能想像要經過如何精密的計算才能設計出長長的高塔嗎如同長長的高塔難以用一般的建築方式完工,長長的 DNA 片段也不易以一般的 PCR 條件製備。在這次的溫故知新小天地裡,小編將簡單介紹長片段聚合酶連鎖反應 (Long range PCR, L-PCR) 這項字面上看似簡單,骨子裡卻不單純的技術。

2016年8月21日 星期日

你不可不知道的 PCR 小技巧 —— HOT START PCR


整理・撰文:楊孟勳、郭芷麟

其實不論做任何實驗,最常碰到的實驗技巧一定都是 PCRPCR 的發明帶給人類科學研究上許多便利。在我們開始學實驗技術時,就算知道實驗的基礎原理,還是會有許多不同的實驗結果產生。要克服這些問題,除了自己努力嘗試各種方式之外,也可以依靠專業人士的經驗傳承。

在這裡,就來分享一個只要 PCR 失敗過一次就會用到,改善 PCR 非專一性產物的最簡單方法——熱啟動聚合酶連鎖反應 (Hot start PCR)

2016年8月18日 星期四

房屋仲介”有巢氏”,PCR也有巢式! —— Nested Polymerase Chain Reaction)



整理,撰文:林沁融

PCR來說,最令人困擾的莫過於非專一性的片段產生。所以為了預防這種事情發生,我們想了許多的方法來解決。上禮拜提到先將溫度調高,在逐漸調低溫度;或是額外加入添加劑,都是不錯的方法。那這次要介紹的是另一種方法,同樣可以提高專一性的巢式聚合酶鏈鎖反應 Nested PCR)。

2016年8月9日 星期二

產物的結果不專一嗎? 來試試Touchdown PCR!!!!!!


整理・撰文:盛威智

PCR技術在現今的生技領域中已被廣泛的使用,然而在做實驗時,時常會遇到非專一性產物產生的情況,影響到我們對結果的判讀,原因有可能是Primer設計的不好、template可能有較多的GC-Rich或是annealing選定的溫度不適當等等。

過去你可能會選擇加入一些添加劑 (DMSOBetaineformamide) 或是重新去抓合適的annealing條件。而今天要跟大家介紹的是一項可以將我們不理想的結果,在設定條件時直接優化的技術,那就是遞減式聚合酶鏈鎖反應。

2016年8月2日 星期二

小小的巧思,大大的運用,PCR 如何成為基因分析利器! —— Real time PCR

整理・撰文:鄭宇恆、郭芷麟

今天我們來跟大家分享一下近年來普遍被使用的 PCR 技術,即時聚合酶鏈鎖反應。全名為:Real - time polymerase chain reactionReal - time PCR,又可以稱為定量即時聚合酶鏈鎖反應(Quantitative real time polymerase chain reaction Q-PCR)。

相信有在做實驗的大家對此技術並不陌生,那如果還沒使用過這個技術,也應該有做過一般的 PCR 實驗吧!一般的 PCR實驗,我們都是用來擴增微量的 DNA,而此技術的原理也是一樣的,只是多了在PCR 反應溶液中添加螢光物質 (DNA binding dye or Probe),當反應循環數增加,目標 DNA 產物濃度也會以倍數成長,再藉由儀器偵測每個 cycle 所產生的螢光訊號。藉由電腦分析 PCR cycle 與螢光讀值間的關係,即可進行實驗結果的判讀!

2016年1月26日 星期二

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