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2016年12月15日 星期四

是誰給了科學家們和醫療人員滿滿的「大平台」!?——Recombinase Polymerase Amplification 之應用與限制


圖片來源:WIKIPEDIA,CC licensed

整理・撰文:王如初、郭芷麟
 繼上一篇了解了 Recombinase Polymerase Amplification (RPA) (全文請點閱此) 的基本原理後,接下來就來跟大家說說這樣的技術,目前有怎樣的應用~


1.       茲卡病毒 (Zika virus) 的尿液快篩
目前茲卡病人篩檢主要是利用Real-time RT-PCR,需要將檢體送到設備齊全的實驗室才能操作。但是,在「資源缺乏的疫區」,我們更需要的是快速方便的檢測方法。

於是有臨床研究人員開發出 reverse transcription isothermal recombinase polymerase amplification (RT-RPA)  檢測技術來篩檢茲卡病毒。它的檢測設備方便攜帶,靈敏度高 (21 RNA 分子即可檢測),檢測時間短 (3~15分鐘),是未來在資源缺乏、大規模感染的疫區一個非常有展望的檢測技術。

2.      精確醫學:癌症客製化標靶治療
癌症在起始、發展及轉移三個階段都會表現不同的分子亞型,稱之為癌症異質性。精確醫學的目的就是結合診斷技術,以及利用這個異質性來針對每個癌症患者的分子亞型,量身訂製治療方法。

在許多開發方法中,RPA 這個技術又躍出水面向大家招手,因為它的靈敏度高且所需時間短 (80分鐘),是目前一個非常令人期待的平台來檢測癌症的 RNA 生物標誌來滿足醫療需求。

大家有沒有發現,RPA 大多用在病毒、細菌感染的快速篩檢,來達到方便、快速、高靈敏度這個目的。讓醫療人員可以更有效率地去進行檢測,使能夠迅速做出對於病患最好的相對應治療方法。

雖然 RPA 看似方便且效果很好,但再好的技術都還是會有一些缺點的!有些科學家指出,RPA 其實不太能夠辨識非常相似的序列;也有科學家指出,RPA 對於一些 contaminants 或是 off-target nucleic acid contamination 更為敏感。

但以上這些缺點,都是由不同的科學家使用之後,所指出的一些問題,然而,並不是每位科學家都會遇到同樣的問題。所以,或許因為 RPA 這個技術近幾年才被科學家們廣泛使用,所以對於他的特性以及條件,都尚未非常熟悉ㄋ。

儘管如此,RPA 還是給予了科學們、病患以及醫療人員滿滿的「大平台」~是一項偉大的 PCR 技術!

資料來源:
1. Toward Precision Medicine: A Cancer Molecular Subtyping Nano-Strategy for RNA Biomarkers in Tumor and Urine,Kevin M. Koo.al , 26 September 2016
2. Rapid molecular detection of Zika virus in urine using the recombinase polymerase amplification assay, Ahmed Abd El Wahed, http://dx.doi.org/10.1101/078501

3.  https://www.researchgate.net/post/How_reliable_is_recombinase_polymerse_amplification_as_a_diagnostic_tool

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