如何克服 GC rich 的 DNA 片段放大問題？

在 DNA 片段中，雙股之間的結合力主要倚靠互補鹼基之間的氫鍵來維持。A 與 T 之間有兩條氫鍵、G 與 C 之間有三條氫鍵，所以 GC 的配對力量比較大。從 PCR 的角度來看，如果目標基因的序列中有比較多 GC 配對的時候，很可能會在放大過程中，產生非專一的局部 GC 配對。又因為 GC 結合力比較強，即使是非專一的結合，也可能產生一些 DNA 的二級構造，而阻礙了 PCR 酵素的前進。

若是以整個人類的基因體來看，AT 配對的數目比 GC 配對來得多，但是根據基因體解碼後的統計發現，GC 配對出現在基因位置的機率比較高。而我們做實驗的時候，通常比較有興趣的地方也是有基因的染色體區域。所以在實務上，我們建議使用者可以先分析一下目標 DNA 的 GC 比例，再來選擇適當的 PCR 產品，這樣子比較能節省您的寶貴時間與實驗經費。

如果您的目標基因很不幸地有很多 GC pairs 的時候，一般來說會建議添加 DMSO 這類的有機溶劑，幫助解開 DNA 二級構造。不過這些添加劑有時候會抑制酵素的作用，反而造成 PCR 產物產率下降。所以很多朋友都必須做很多組實驗來找到最佳的反應條件。

針對這個問題，Ten Giga Bio 的 PerfectRead DNA polymerase 經過特別調教，我們把酵素與反應緩衝液做了最佳化的組合。在我們的測試中，一般市面上同等級的酵素最多只能處理具有 60% GC pairs 的目標 DNA，並且還會出現非專一的產物。而 Ten Giga Bio 的 PerfectRead 則可以順利放大含有 70% GC pair 的目標 DNA，並且不會有非專一產物出現。

我們相信在絕大部分的情況下，您可以直接使用我們的 PerfectRead DNA polymerase 而不必再額外添加 DMSO 等試劑，也相信這樣讓各位的實驗工作變得更簡單、更有效率，而這就是我們的目標。

讓您專注在更重要的研究工作上，把 PCR 的問題交給 Ten Giga Bio 來幫您處理吧！

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